A felhasznált szaporítóanyag részben Selmecbányáról származott, de folyamatosan gyűjtötték a fajokat Magyarország és Európa erdős területeiről. Az 1940-es évek közepén beindult a botanikus kertek között a nemzetközi magcsere program, melynek keretében jelentős támogatás érkezett az akkori szovjet, japán, amerikai, svéd, német és norvég botanikus kertektől, ezzel nagyot lendítve a Kert növénygyűjteményén. 1965-ben az intézmény 4, 5 hektárral (Felső Botanikus Kert) bővült, majd 1977-ben újabb 2, 2 hektárral (kollégiumok udvara), így érte el mai kiterjedését. Botanikai értékek A kedvező mikroklímának köszönhetően a Kert egyedülálló fenyő- és örökzöld gyűjteménnyel rendelkezik. A látogató mintegy két tucat jegenyefenyő fajt, több mint harminc borókafajt és számos más külhonos fenyőfajt láthat. Kiemelkedő értékű fafajok a fenyők közül a nikko-jegenyefenyő, a mandzsu jegenyefenyő, a mexikói selyemfenyő, az óriástobozú fenyő, a japán fehérfenyő és a tiszafák három faja, továbbá a lombos fajok közül a szikfa és a japán szil.
A Botanikus Kert megújítására az Európai Unió Regionális Fejlesztési Alapjának Interreg Szlovákia-Magyarország támogatási programjának keretén belül, a Treejoy-SKHU/1601/1. 1/217 pályázat (Közös örökség, közös jövő – fák, határok nélkül) megvalósításával kerül sor. A támogatási összeg az egész projekt vonatkozásában: 1. 461. 000 EUR A Soproni Egyetemre jutó rész: 549. 000 EUR A projekt célja, hogy a Botanikus Kert megújításával hozzájáruljon a térség turisztikai potenciáljának fejlesztéséhez, szolgálja a helyi lakosság, a turisták és az egyetemi polgárság érdekeit. Új, modern, interaktív eszközökkel kívánja elérni azt, hogy megfelelő színhely legyen az erdei pedagógiának, a tanösvények látogatóinak, és egyfajta "természetes tornateremként" szolgáljon a kocogók, a sportolók számára. A magyarországi erdészeti felsőoktatás első botanikus kertje Kisiblyén jött létre (mai Kisiblyei Arborétum, Szlovákia), majd az első világháború után, mikor Selmecbányáról költözni kényszerült az akkori akadémia, hoztak létre Sopronban is egy botanikus kertet (mai Egyetemi Élő Növénygyűjtemény).